南通大学2022年在全国本科院校排名第179位，学校设有105个本科专业（2021年招生专业77个），涵盖文学、理学、工学、医学、艺术学、经济学、法学、教育学、历史学、管理学等10个学科门类。

南通大学2022年在全国本科院校排名第179位，本省大学排名第21位。

南通大学2021年全国本科大学排名第178位，2020年排名第187位，2019年排名第186位。

学校设有20个学院、1个独立学院（杏林学院）、1家直属大型综合三级甲等医院（南通大学附属医院）和国际教育学院、继续教育学院。拥有基础医学、临床医学、信息与通信工程3个博士后流动站，基础医学、临床医学、信息与通信工程、公共卫生与预防医学、特种医学5个一级学科博士点，23个一级学科硕士点，19个硕士专业学位点。